第三方面，为了提高试管婴儿的*率，会给患者移植超过一枚的胚胎，就会出现多胎妊娠的情况。多胎妊娠可能增加早产率，流产率以及产科的各种并发症。目前由于辅助*殖技术的提高，单胚胎移植是一大趋势，因此多胎妊娠的几率是下降的。
此外试管婴儿也有可能出现宫外孕。虽然医师会把胚胎植入到*最好的位置，但是植入之后胚胎不是马上着床，而是有一段时间的游走，在这段时间胚胎可能游走到*之外着床，此时就发*宫外孕。
一旦发*宫外孕，一定要及时的治疗。但试管婴儿的促排卵治疗不会导致卵巢早衰，虽然正常的女性每个月只有一枚卵子发育成熟并且排卵，但每个月实际消耗掉的卵子至少是15-20个以上，药物的作用就是把这些即将消耗掉的卵子重新挽救回来，使它最终也可以成熟，而不是提前消耗了储存的卵子。
