一代试管主要针对的是女性不孕，是不会对男性畸形精子进行过滤的。通常男性精子畸形率50%，属于是较为严重的情况了，已经严重影响到了生育，这时候一般都是建议做二代试管婴儿，通过精子洗涤法、上游法、密度梯度离心法这三种方法，来对精子进行筛选滤掉，再通过卵胞浆内单精子显微注射技术培育成胚胎，移植到女性的宫腔内达到助孕的效果。
临床上，常用到的精子过滤法是密度梯度离心法，不过不同医院和机构使用的方法是不一样的，建议患者可以咨询自己所选的试管医院。以下是试管中常用的几种处理精子的方法，具体如下：
1、洗涤法：就是用培养液稀释精液标本，直接离心，收集沉淀的精子团，该方法可回收多的精子，但夹杂死精子和其他细胞碎片；
2、上游法：该方法是根据精子的泳动能力来选择精子，将培养液加到液化精液上方，也可以将精液加到培养液的下方，活动的精子会自动游泳到培养液里表面呼吸新鲜空气，将聚集在培养液表层上方的优质精子收集备用；
3、密度梯度离心法：由于活的精子、死的精子、白细胞及细菌等沉降系数不同，在一定的离心力的作用下，会有不同的沉降速度，形成不同的梯度液区，此时不利因素的精浆就会浮在液面，精子沉淀于试管底部，完全将优质精子和精浆分离开来。
总的来说，第一代试管婴儿是不可以删除畸形精子的，不过患者可以通过二代试管婴儿的显微技术来筛选精子，或是通过以上方法来处理精子，提高精子质量。另外，考虑到精子畸形率较高可能和不良的生活习惯、饮食习惯和生活环境有关，建议各位有生育需求的男性在日常生活中一定要主动远离可能会影响精子质量的不良因素，从而保障自己的精子质量。
